20XX(2032)年，世界的人们都对电脑异常犯罪恐怖份子感到恐惧，各国的军事组织对之前电脑病毒「WHITE-BABY」在网际网路上的出现，都感到忧心冲冲。 而「WHITE-BABY」是一种新型电脑病毒，它主要能夺取各个国家的军方电脑系统的控制权。 这个电脑恐怖份子的组织叫做「AMADEUS」(意为被神锺爱的人)，到处利用「WHITE-BABY」破坏各个网路的安全系统来显示自己的能力。 於是在得知这项消息之後，国际紧急对策讨论会(名字好难翻译||||.....)便决定实行两个主要方案。首先先加强讨论会的阵容。然後就是想办法派兵阵压AMADEUS。然而网上打击AMADEUS的行动早已展开了，於是安排突击部队的攻击一事也迫在眉睫.....这只是事情的序曲罢了。

合金弹头4（Metal Slug4）由Mega Enterprise开发，风格和控制类似于以前的作品，两个新面孔的角色Trevor和Nadia将出现在开始阵容中，合金弹头4中你的敌人大多是士兵和各种各样的敌军战斗车辆。狙击手、刀手、直升机、坦克、吉普车、等各种作战对象都将出现在游戏中，游戏中将出现的武器有双管机枪、霰弹枪、喷火枪、火箭筒、铁晰蜴等。

游戏中如果你奖分食物吃的太多的话，会变大变胖，游戏中幽默风格依然，在一个关卡中主角如果被科学家用标枪打中的话，会变成猴子，当变成猴子后，主角可跳的更高，还可爬绳子。