2000年Metal Slug系列的第三作.仍旧沿用2代的系统,补充了一些适用于特定环境的弹药品种,但其中绝大多数都已经在MSX中有过表演.本作的主要热点就是分支系统的加入,除最后一关外的关卡都有不同路线可走,场景以及出场敌人会有很大不同。

主角的状态比起MS2大大丰富了,除了很受欢迎的胖仔,令人头痛的木乃伊化之外,潜水,宇航,飞行各种状态都有不同的火力表现,特别是丧尸化主角的"吐血绝招" 即使是Boss也只能挨几下.在MSX中的谜之隐藏关所登场的潜艇,直升机等乘物纷纷现身,鸵鸟,大象,钻头坦克...几乎到了眼花缭乱的地步。

敌人方面，除了Morden的部队还有寄居蟹.水母.巨鱼.形形色色的僵尸.木乃伊.潜艇.球机器人.吃人花.虫子.大肉虫.蜗牛等等让人始终保持着一种新鲜感。在音乐上较前作有了极大的改进。配合着每一关，将海滩的新奇，午夜的恐怖，工厂的阴森，沙漠的火热等各种关卡独有的风情体现出来。

剧情上，由与XX兵的决战，到后面队友被俘虏，战斗变成人类与外星人的决战，使得战斗变得越来越激烈。游戏的难度也是系列之最。

MORDEN元帅的新政权叛乱行动已成历史。秩序且和平看似又回归到了世界......，只是MORDEN是不会死心的，他曾一度企图再来个东山在起，但政府却早料到他的阴谋，在一次闪电突击中令其无法有再出头的机会。参与之前打击MORDEN势力的两位大将。在PF队中的MARCO和TARMA，这次请辞又被退回，只得继续带领PF队(一个是队长，一个是副队)。

仅管MORDEN的下落被灌上"失踪"二字，但他的追随者仍是遍布全世界，对MARCO及TARMA来说，将这些追随者一个一个地绳之以法正是本份所在。然而这些追随者开始暗中涌起一些狂暴的斗争行动，.....MARCO和TARMA无法阻止，却也渐渐地查觉到MORDEN即将再兴起的第三恶魔计划!!同时，在SPARROWS，正规军情报部中的特殊工作队，也在他们一连串的追击MORDEN势力的行动中，发生了一些奇异的事件。从政府BIG WIGS中的家畜被劫持失踪到一些人看见奇怪的大型生物出现....。这些怪事似乎只能引领他们推测一种更残酷的情形。看来MORDEN元帅的出头恐怕不是唯一需要担心的事件了..........